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为了即将在“密苏里”号战列舰上举行的投降仪式，尼米兹曾令海军修建大队在关岛为麦克阿瑟整修一艘专供陆军官员使用的登陆艇，用它载麦克阿瑟去停泊在横须贺外海的“密苏里”号。但当他派人把这艘登陆艇送交麦克阿瑟时，麦克阿瑟却说：“太小了，我不乘这个小玩意跑20海里。”尼米兹可能不知道，其他大多数军官、新闻记者甚至日本特使都将乘驱逐舰去“密苏里”号，堂堂的盟军最高统帅怎么可以乘坐小小的登陆艇呢？麦克阿瑟还通知参谋人员让尼米兹知道，他希望在“密苏里”号上悬挂他的陆军五星上将旗。但是，根据海军的传统，军舰的主桅只升上舰的最高海军军官的将旗。最后，尼米兹的副官拉马尔想了一个解决办法，即把麦克阿瑟的红色将旗和尼米兹的蓝色将旗并排升到主桅上。把两面将旗一齐升到同一根桅杆上，这在海军历史上还是第一次。
美军进驻横滨和横须贺后，日美双方就开始为举行正式的投降仪式作准备。投降文件的原稿是河边特使从马尼拉带回来的“第1号总命令”、“诏书*案”等三种文件之一。当日本政府与大本营审议这份文件时，对于文件中使用的“投降”字眼仍有不同的意见。在东久迩内阁阁员中，除了陆海军大臣外尚有军部出身的国务大臣。这些军人认为，在太平洋战争中，海军虽然战败，陆军并没有战败，因而反对使用“投降”这个词。但是，面对盟军强大的实力，内阁成员们又不敢修改一个字，最后只得依原样通过。
在签署投降书方面，盟军要求有代表天皇及日本政府的和代表大本营的两种代表。于是，重光外相决定从陆海军里各选出一名代表，从政府里选出两名：一名应是“身为政府首脑且处在能履行投降条件的地位上”，另一名应是“能让盟军方面充分了解日本的诚意的人”。可是，新任首相东久迩宫亲王以身为皇室成员、不应前去受辱为由；拒绝充当首席代表。性格一贯软弱的近卫副首相也以自己身为皇族近亲为由而予以拒绝。最后，只得由重光外相代表天皇及日本政府，梅津参谋总长代表大本营。梅津十分不乐意承担这项任务，但在与重光一起聆听天皇的嘱托后，便改变了看法。
就在日本正式签署投降书的前一天，也就是9月1日，世界各主要报纸和电台都用极大的篇幅报道了一份极具震撼性的文件。
这份文件是从刘建业的部下在抓捕石井四郎的时候一并带走的箱子里面所发现的一份石井四郎中将已经写好但是尚未来得及向部下下达的手令。
这份写在一本大笔记本上的手令详细描述了日本天皇宣读投降诏书后的第二天——8月16日起至27日（也就是石井四郎被捕这一天）期间，731部队的详细行动。
石井四郎中将下令：“尽可能多地将‘圆木’和PX从满洲抢运回国，民用船只也可以动员起来运送武器与装备。由于美军将于8月25日由东京附近的相模湾登陆，所以我们要抢在他们之前将细菌战武器分布在日本全国，伺机对进驻日本的美军发动全面细菌战争。”石井四郎中将还详细列举了对美军实施细菌战的三种武器——中国“圆木”、“满洲”PX与日本美女。
中国“圆木”指的是携细菌的中国受害者。根据日本关东军第1539号命令，“石井部队”将平房地区120平方公里划为特别军事区。731部队在生体试验中心——“四方楼”中央秘密建有“特设监狱”。他们将被实验者称为“马鲁他”，即“圆木”的意思。731部队主要采用“特别移送”获得“圆木”，就是由各宪兵队不经过审判，将在各地抓获的中外人士秘密押送到731部队监狱。731部队成立之初，也曾到大街上任意抓获普通老百姓当作“圆木”。据《前日本陆军军人因准备和使用细菌武器被控案审判材料》中731部队原队员供诉，仅在1939年至1945年间，731部队就将至少3000名中外人士直接杀害在各种活体试验中。731部队原队员供称，1945年8月，731部队在溃退前杀死了所有的“马鲁他”，没有一名幸存者，但现在看来731部队极可能秘密运送部分的“圆木”回日本，只是在阴谋破产后在日本杀害。
“满洲”PX指提是沾染了细菌的跳蚤。该武器由731部队第四部提供。第四部是个“大型生产细菌战武器的制造厂”，一次性可培养近8吨各种细菌营养液，可培育出4万万亿微生物，一个月内就可生产鼠疫细菌300公斤、伤寒症细菌900公斤、炭疽热病菌600公斤、霍乱病菌1000公斤，其中，第四部每三四个月生产45公斤跳蚤，相当于1。45亿只！
日本美女是比较疯狂不成熟的设想，就是由甘当“自愿者”的日本女性充当携菌人，然后与美军高阶层军官进行“亲密接触”，以期达到“奇袭”的效果。这也并非是石井四郎中将“奇思异想”。事实上，日本此前有过战争史上最肮脏的“金马计划”。金马是日本著名人体病毒学博士，日本军国主义的疯狂追随者。1942年春，他带着自己的科研成果向军部提出了一个无耻的建议。太平洋岛屿的土著居民，性格粗犷豪放，再加上天气炎热，女性多袒胸露腹，甚至有不着裙裤者，性关系比较混乱。在太平洋作战的美军士兵性行为一向不检，接触土著妇女，极易做出荒唐事。沸騰文學鉴于此，金马建议，在日军撤出前，可先使岛上妇女感染性病病毒，以期在美军士兵中迅速传染，削弱其战斗力，皇军则可不战而胜。为了挽回败局，日本军部在1943年春采纳了“金马计划”。为获得大量性病病毒，金马带着助手们日夜奋战，在他的实验室里培养各种病毒，除一般淋病、梅毒外，还有一种俗称“雅司病”的热带性病病毒，感染后生殖器腐烂流脓，绝无医治的特效药，患者很快就会毙命。金马的性病病毒，既有针剂注射，也有口服片。1944年，金马的各种性病病毒已经准备就绪。他率领一支由医生、护士和检疫人员组成的“特种作战部队”，从日本本土搭乘一艘大型潜艇，携带一大批这种世界上最缺德的“武器”，开赴太平洋马里亚纳群岛给土著妇女们接种病毒。
与文件同时被公诸于世的还有一份日本陆军省军事科科员、统管军事科学情报的陆军参谋新妻清一元中佐的口供。
新妻清一元中佐在口供里承认日本军方在30年代初就已经开始进行在战场上使用细菌武器和化学武器的研究；并且这些严重违反国际公法的武器在中国战场上不止一次的被日军使用，日本军队也曾经对苏俄军队使用过细菌武器，但是具体效果还不清楚；他与石井四郎会面，是奉命向其转达由日本陆军参谋总长与参谋次长下达的禁止对登陆的盟军部队使用细菌武器的命令，要求石井四郎及其部下伺机等候未来的时机。
在关于日军参谋总部为何紧急叫停石井四郎的疯狂行动的问题上，新妻清一元中佐解释说，这有可操作性差的问题，由于日本已经投降，再想从中国东北运“圆木”到日本的可能性几乎为零，而且，日本陆军最担心，也是喝停731部队疯狂阴谋的根本原因是为了保住日本人自己的性命，甚至要避免“绝种”的3险。
这并非耸人听闻，尽管731部队握有细菌武器的部分“解药”，但由于战争已经将日本国内的防疫系统和药品生产能力全部催毁，一旦细菌武器在日本列岛发挥作用，日本民族可能会被它自己毁灭。其次是担心盟军的报复。广岛长崎的原子弹经历已经彻底摧毁了日本军人的战斗意志，一旦731部队得手，盟军在细菌武器下伤亡惨重的话，那么不排除美军对日本再度动用原子弹实施的复的可能性，这同样也会让大和民族“绝种”，综合上述原因考虑，日本陆军最高层喝停了731部队的疯狂。
这两份文件的公诸于世，让日本政府和军队在世界舆论面前被彻底撕掉了遮羞布。世界舆论为此一片哗然。各主要盟国政府均公开表态，表示在战争结束以后将对日本政府和军方在这方面的罪行进行彻底的清算，并追究相关责任人的战争责任，即使是日本的天皇本人，如果有足够的证据证明天皇本人或者皇族涉及此事，均将被送上国际法庭予以严厉审判，毫不姑息。
当麦克阿瑟将军知道了这两份文件以后，也是暴跳如雷，发誓要让所有涉及此事的日本人全都不能逃脱被送上绞刑架的惩罚。
就在麦克阿瑟将军因为日本人卑鄙无耻的阴谋而暴跳如雷的时候，刘建业则正在横滨市内的旅馆房间里略带忧郁的品着来自法国的红酒。
“你们美国人当初能够和石井四郎他们以交出细菌实验资料为条件，不追究他们的战争责任，不就是因为当时的人们还不清楚731部队的性质和所作所为吗？现在，我把这些东西一点点的公开，让全世界的人都知道，我看你们美国人还敢不敢悄悄的放过这些十恶不赦的家伙。”想到这里，刘建业举起酒杯，对着天空说道：“被731部队这个恶魔杀害的同胞们，我以我军人的荣誉向你们发誓，我将尽我所能把他们送上历史的审判台！！”
第三部
→第三百二十章 … 日落（十）←
日本无条件投降签字仪式定于1945年9月2日上午九时在美国海军“密苏里”号战列舰上举行。
为什么将这一举世瞩目的仪式放在军舰上？虽说“密苏里”号是一艘排水量高达4。5万吨的超级战列舰，拥有宽敞的甲板。但是东京尽管在美国大规模空袭中遭到严重破坏，还是有几处可以容纳上万人的场地，比起军舰甲板还是宽敞的多，那是为什么呢？原来事出有因，杜鲁门总统在日本投降宣布由麦克阿瑟出任驻日盟军最高司令，负责安排和主持日本投降仪式，并作为同盟国代表在投降书上签字。这一决定立即引起了海军的强烈不满，激发了陆海军之间根深蒂固的军种矛盾（此时空军还没有成为独立的军种），海军在战争中出力甚多，到了胜利一刻，却让一位陆军将领站到台前，这将给人以主要是陆军将日本打败的印象，因此海军部长福莱斯特建议，如果投降仪式由陆军将领主持，那么仪式应在一艘海军军舰上举行，此外麦克阿瑟作为同盟国代表签字，那么尼米兹就将作为美国代表签字，以表彰海军在战争中所作出的贡献。为了保证总统同意这一建议，他特别选择以杜鲁门家乡命名，并由他女儿马格丽特主持下水典礼的“密苏里”号作为候选军舰。——这一建议立即获得批准，这样“密苏里”号就成为这一重大历史事件的场地。
哈尔西得知他的旗舰将成为签字仪式所在地，非常高兴，并特意致电海军军官学校博物馆，请求借该馆收藏的一面旧国旗，那是一面长165厘米，宽157厘米，只有三十一颗星的旧国旗，却是大有来历的，九十二年前就曾到过东京湾——悬挂在1853年首次用舰炮打开日本国门的美国海军舰队司令马修；佩里准将的旗舰桅杆上！哈尔西这么做，无非是要证明美国海军的赫赫军威！该馆同意了他的请求，并派专人用专机将这面国旗送来，哈尔西将其装入玻璃镜框，高挂在自己指挥舱室的门上，正好俯视着仪式的举办场所右舷露天甲板！
9月1日上午，“密苏里”号上举行签字仪式预演，几十名水兵扮演参加仪式的贵宾，在右舷露天甲板上预演了明天的仪式。
晚八时举行了由麦克阿瑟主持的受降预备会议，出席投降签字仪式的苏联代表普尔卡耶夫，提出应在“密苏里”号上升起所有对日本作战国的国旗。麦克阿瑟竟不以为然地说：“就让美利坚合众国国旗作总代表吧，她有这个资格！不是吗？朋友们，哈哈！”他笑得很轻松，也很自豪。与会者惊愕地面面相觑。普尔卡耶夫想到自己是第一次与麦克阿瑟打交道，又见其他代表也没有坚持，也只好一笑置之。从这件小事中可以看出此时美国的强横与嚣张，给投降仪式和战后的各国关系蒙上了一层阴影。
9月2日，历史性的日子终于到来了，美中不足的是天�