9日，他们把所有提倡改革的人赶到新军的兵营中加以屠杀，然后迫使苏丹逊位。
他的堂弟穆斯塔法四世当然是得到军队中反动份子支援的，但是他只作了一年苏丹就被西利斯特里亚的总督穆斯塔法·贝拉克塔尔所推翻。既然赛里木已被处决，他的弟弟麦哈茂德二世继任爲苏丹。但是反动派的势力仍然很强大，以致不久贝拉克塔尔就不得不屈服，而麦哈茂德由于外交方面的失败也被迫推迟实行使他成爲近代土耳其的奠基者的改革计划。麦哈茂德在对俄国进行的战争中失去了尼科波里斯、西利斯特里亚和鲁斯查克。只是由于拿破仑进犯的危险才使得沙皇于1812年5月28日签订了布加勒斯特和约，根据和约，沙皇放弃了进行新的征服的打算，承认普卢特河爲边界。对帝国更危险的是被征服．民族的起义。早在 1804年塞尔维亚人在卡拉柯奥尔吉奥斯领导下已经起义。在最后一次战役中，他们曾给予俄国人以有力的支援。爲了对这件事表示感谢，俄国人坚持要给予塞尔维亚人以半自治的地位并且有自己的法庭，以此作爲缔结和约的一个条件。但是由于塞尔维亚人的主要不满——纳贡的义务——并未消除，他们继续进行斗争。在卡拉格奥尔吉奥斯逃到奥地利去之后，米劳什，奥卜赖瑙维奇接替了他。1820年发生了希腊的起义，这个受到欧洲慷慨激昂的希腊热所鼓励的起义事件结果不仅使奥斯曼失去了不十分宝贵的一省，而且特别也引起了无穷无尽的外交纠纷。但是苏丹却消灭了大公们（鲁美利亚的阿伊安和安那托里亚的得勒贝）的独立，并且恢复了中央政府在各省的权威。
在所有这些战役中，新军再一次证明是完全不中用的。但是麦哈茂德很好地利用了反动派强加在他身上的等待时期，逐渐地任命对他个人忠实的人来担任最重要的职务。1826年春天，他终于重新开始了赛里木的计划。俾科士的总督将安那托里亚的民兵集合在博斯普鲁斯海峡的东岸。在这些民兵的保护下，麦哈茂德发布了建立新的正规军的命令，称爲毛来姆，爱希金吉（受过训练的卫兵）。埃及总督穆罕默德·阿里将所需要的教官派遣给了麦哈茂德。麦哈茂德的计划得到了新军军官的赞同，但是下级军官却变本加厉地反对这项改革。麦哈茂德下令于6月18日在伊斯坦布尔附近的甜水谷检阅新的兵团。爲了阻止这次检阅，新军在三天之前举行叛变。最初他们只要求取消训练条例。但是在教士们的同意下，苏丹下令展开先知穆罕默德的大旗，就象要对异教徒作战一般，并且迅速动员军队，将新军包围在他们的兵营（阿特米丹）之前的广场上。穆弗蒂庄严地宣布对他们的咒诅，然后开始了一场大屠杀，没有一个人得以幸免。在城中的其他地区约有一千名新军被杀。他们的军旗和他们的标志——新军军帽——被践踏在污泥之中。他们的清真寺和常去的咖啡店都遭到破坏。和他们有关的比克特西教团以及和他们有密切关系的消防队和挑夫的组织都被解散。甚至在炮手和博斯普鲁斯海峡的看守人（他们这一次对苏丹保持了忠诚，虽然在另外情况下他们常常和新军是一致的）中，所有有反动倾向嫌疑的人都被消灭。
但是西方国家并未给苏丹以时间来取得这次血腥改革的成果。1827年7月7日，法英俄三国缔结了三国同盟条约，随后普鲁土也参加了这个条约，条约的目的是爲了要迫使苏丹承认希腊人民的独立，因爲这时穆罕默德·阿里的儿子易卜拉欣和他的埃及援军已经在紧紧地进逼摩里亚的叛乱分子。经过六个月的围攻后，叛乱分子的最后一个堡垒密索朗吉被迫于1826年4月23日投降。帝国舰队沿着摩里亚海岸出现，载运了四千步兵和五百名骑兵来援助易卜拉欣。但是在舰队停泊的那瓦林港前出现了盟国的地中海联合舰队，这支舰队不准担任舰队司令的易卜拉欣在希腊沿海进行任何新的活动。由于易卜拉欣拒不同意盟军对他的军事上司的最高权力所进行的这种干涉，10月20日发生了灾难性的海战，在六小时的交战中，拥有一百多只军舰的帝国舰队全部被歼灭。
帝国政府没收了停泊在金角湾的所有外国船只作爲对和平时期进行的这种可怕攻击的回答。在谈判毫无结果的情况下，三国同盟的代表于12月中旬离开了君土坦丁堡。但是直到第二年5月俄国在有了充分准备之后才发动战争。在战争的第一年，俄国军队在巴尔干半岛和高加索都没有取得任何进展。 1829年春天，德比什亲王担任了欧洲俄国军队的指挥官。他包围了以前拦阻大军前进道路的舒姆拉，向前推进直抵亚德里安诺堡。 9月14日他在亚德里安诺堡强使苏丹接受了一项和约。俄国满足于得到多瑙河中的岛屿以及高加索的伊麦雷吉亚和格鲁吉亚两省之间的土耳其领土。但是苏丹必须参加伦敦条约，也就是承认了希腊的独立。
当麦哈茂德仍然在徒劳无功地力求通过改革加强国家的效率时，他的埃及封臣穆罕默德·阿里在这条路上已经远远走在他前面了。这位近代伊斯兰教历史上最重要的人物，于1769年1月生于马其顿海滨的卡瓦拉，他的叔父是那里的“穆塔萨里姆”（副总督）。穆罕默德·阿里没有受到过任何真正的教育，但是在他叔父的政府首脑会议中得到了关于实际事务的初步知识。在他二十岁时，他已经在他家乡的主要商品———烟草——上大作投机生意了。但是这个遥远的省份对他的野心说来是太狭小了。
甚至在1517年赛里木征服埃及后，麦木鲁克人在那里仍然保持着他们的权力。对奥斯曼帝国来说，这个国家除了以贡礼的方式缴纳赋税之外，主要作爲保持帝国在叙利亚和阿拉伯的权力的作战基地。只是在拿破仑把埃及看作攻击英国在印度的霸权的必经通道之后，埃及才进入了世界政治的舞台。爲了保持它在红海的航运，英国于1778年和麦木鲁克的阿里贝缔结了一个通商条约，阿里贝曾经对帝国政府保持了一个短时期的独立。1798年7月，拿破仑以麦木鲁克人的苛政危害了法国居民的财産爲藉口向埃及进行远征。他在金字塔附近取得胜利后暂时结束了麦木鲁克人的统治，虽然8月1日纳尔逊在阿布基尔的胜利已经使法国在这个国家的地位难以维持。不管苏丹赛里木三世以前对这个国家如何不关心，这时他也不能看着他的主权受到侵犯而无动于衷。因此他在1799年夏天派遣了几只船载运军队到埃及。穆罕默德，阿里的叔父也有义务提供一支三百人的部队。他派了他的年轻的儿子去指挥这支部队，并且派穆罕默德·阿里去作顾问。在埃及登陆之后不久，穆罕默德·阿里就正式地统率了这支军队。随后发生的战争迫使法国人于1801年从埃及撤退。在这次战争中，穆罕默德·阿里名闻遐迩，因此他一跃被提升爲将军。法国人撤退后，一个过去的阿卜克哈兹族奴隶豪斯赖伍被任命爲帕夏。由于他不久就一心一意地在搞宫廷的阴谋，埃及对他说来只不过是他的向上爬的梯子上的第一步，他的一切努力都是爲了使他能够很快地带着大量财富离开这个国家。由于穆罕默德·阿里在他的阿尔巴尼亚军队中保持着比总督的军队更要严格的军纪，他巧妙地离间麦木鲁克人和豪斯赖的关系逐渐地使全部下埃及隶属于他的统治下。 1803年豪斯赖伍从他的已经无利可图的差使上被召了回去。他的第一个继任者只干了几个月，穆罕默德·阿里就让开罗的爱资哈尔清真寺的教土根据宗教法明确地宣布他是权力的承担者，爱资哈尔清真寺在伊斯兰教世界中被尊崇爲宗教研究的学府达几个世纪之久。 1805年11月穆罕默德·阿里成爲全国事实上的主人，1806年4月帝国政府不得不承认而且批准他爲瓦利（总督）。他暂时让麦木鲁克人统治上埃及，交换条件是后者缴纳巨额的贡金。但是当他们开始和英国谈判时（后者的登陆部队于1807年4月被他在罗塞达击退），穆罕默德·阿里在1811年3月中邀请他们的头子到开罗来，名义上是爲了商量关于对阿拉伯的瓦哈比派作战的事情。3月11日他在开罗将他们三百个人全部杀死。
这样穆罕默德·阿里就成爲埃及的绝对统治者。这是在他以前的帕夏没有人作到的。但是他的阿尔巴尼亚军队仍然受到奥斯曼军队很深的影响，他们在和瓦哈比派几次作战中都不孚原来的期望，因此直到1815年他一直忙于对付瓦哈比派。他试图让这些军队习惯于严格的纪律，结果1816年在开罗发生兵变。但是他毫不费力地就把这次兵变镇压了下去。随后他将军队全部解散，改征农民入伍。他用欧洲武器把它配备起来，并交给后来成爲帕夏的塞韦上尉仿照法国军队加以训练。他用这支军队，在一系列的战役中征服了努比亚、塞那尔、顿古拉和达弗。实际上这些战役只不过是大规模地搜索奴隶而已。
但是穆罕默德·阿里也注意到了这个国家的经济发展。他不但以无数奥斯曼式的建筑来装饰开罗和亚历山大，还在亚历山大建造了海港，用运河将这个城市和尼罗河的西支联结了起来。但是他把这个国家完全看作是私人的田産，而他的唯一的目的就是要从这块田産上榨取最大的收入。1815年他占有了棉花，大麻和亚麻的全部出产。两年之后他也占有了靛青、芝麻和其他的油料作物的全部出产。但是这些收入还不能满足他的贪心。到1812年时，他已经并吞了所有的宗教基金和全部封地。这时他设立了一个委员会来检查所有房地産的地契。凡是没有地契的（大多数世代相传的农民自然都没有地契），从那时起都得作爲帕夏的佃农来耕种他的土地。按照古代东方的惯例，他征用了所有的木材和建筑工人来建立一个舰队，并且以规定的价格买进所有输入的木材。他的不顾一切的关税政策造成了生活费用难以容忍的上涨乙由于这种政策对来自其他伊斯兰教国家的货物比来自欧洲的货物抽税更重，这就更加使人感到透不过气来了。
穆罕默德·阿里对欧洲文明所带来的福泽看来非常羡慕，因爲欧洲文明有使这个国家的生産力增加的希望。模仿欧洲学校建立的第一所学校是一个采用英国教学方法的算术学校。但是在其他方面，法国人在宫廷中占有优势。除了一些真正关心于国家情况有所改进的人们之外，他花了钱上了一大群骗子的当之后才能找到一个有足够能力安装工厂设备的人。尽管他的自私自利的政策造成了许多错误，在使这个国家接受欧洲文明的影响这件事上应当归功于穆罕默德·阿里。
穆罕默德，阿里势力日增不免引起了伊斯坦布尔的不安，伊斯坦布尔怕他在和外国的关系上迟早也要超越出他的省总督的职权。最初他确实在小心翼翼地避免任何看起来可能触犯对苏丹应有的尊敬的事情。因此他毫无异议地提供了军事援助来镇压起义的希腊人。他的儿子易卜拉欣把在那瓦林被歼灭的帝国舰队的残余船只和埃及船一起开到了亚历山大港以便修理这些船只。当帝国政府命令他派遣自己的舰队和土耳其舰队同时开到伊斯坦布尔时，他汇了笔款来疏通这件事，汇款总是受到欢迎的。爲了酬谢他承担和俄国作战所借的战债的一部分，帝国政府甚至将克里特岛授给他作封地。
但是过去在埃及兴趣的每一个大国都必然向叙利亚扩张它的势力。帝国政府也曾答应将叙利亚给予穆罕默德，阿里以酬谢他在希腊战争中的帮助，但是没有实践他的诺言。穆罕默德·阿里可不打算放弃这个地方，因之很容易找到了和亚克的帕夏发生冲突的藉口。在穆罕默德，阿里的土地政策下，民不聊生，农民成群结队地迁入了叙利亚，穆罕默德·阿里自然不承认苏丹的臣民在帝国内有迁居的自由。
1831年秋天，穆罕默德·阿里派遣他的儿子率领一支军队进入叙利亚，他的儿子在亚克包围了阿卜杜拉帕夏。但是虽然有舰队支援着陆军，这个要塞的围攻一直到了第二年5月。穆罕默德·阿里对帝国政府要他撤兵的温和命令的回答是要求赐给亚克和大马土革两省作爲封地。同时，在黎巴嫩的国君伯什尔·什哈比的帮助下，易卜拉欣征服了全部巴勒斯坦。伯什尔是经过长期拖延之后才和他联合在一起的。随后在亚克也陷落之后，他于1832年5月26日一直推进到西里西亚的首都亚达那，并未遇到任何抵抗。与此同时，苏丹武装了军队来对付他的叛变的封臣。这时一支五万人的大军在前新军军官侯赛因帕夏率领之下向南方前进。侯赛因和军政大臣豪斯赖伍帕夏不和，豪斯赖伍帕夏把他的养子穆罕默德帕夏任命爲侯�